生活在深山小镇的女高中生三叶，梦见自己变成了一个男孩，来到陌生的房间里，遇见陌生的友人，眼前则是一片东京街景。而生活在东京的男高中生泷，也梦见自己变成了女高中生来到深山小镇里。不久，他们意识到自己在彼此的梦中交换了灵魂——素未相识的两人就此邂逅，命运的齿轮也开始转动。故事发生在每千年回归一次的彗星造访过一个月之后，日本某个深山的乡下小镇。女高中生三叶每天都过着忧郁的生活，而她烦恼的不光有担任镇长的父亲所举行的选举运动，还有家传神社的古老习俗。在这个小小的城镇，周围都只是些爱瞎操心的老人